921災後整體復建重建工程極為龐大與複雜，列管的工作計畫在全盛時期高達19,281件；其中，中央政府執行的有4,590件，占計畫總數45﹪，在經費執行方面，中央政府執行之計畫經費總數約占總經費65﹪，地方政府執行之計畫經費約占總經費35﹪。包括88下半年及89年度震災搶修、重建追加預算數有新臺幣（以下同）1,061億元，執行機關高達100多個。90年度災後重建之特別預算（一、二期）1,000億元，特別預算分配在民間部門的重建經費占62.82%，公共建設占37.18%，執行機關亦多達100個。921重建會為求清楚掌握災後重建與復建工作之執行情形，並追蹤控管各項計畫之進度及經費執行，依據重建業務之特殊性與時效性，分為「追蹤控管案件」及「計畫管制控管案件」2大類。除網路控管以及書面控管月報（週報）的提醒外，921重建會也設計主秘控管會議、縣市控管會議、專案控管會議、定期查證、聯合查證、年度考核等方式，廣泛的進行各個層面的督導，控管的查核點有：未上網填報資料的督促、重大落後案件（又分為落後10%、20%或30%等3級）的督導、未發包案件的督導、網路控管異常（通常為預算執行率與計畫執行率重大落差）的督導等。總計重建預算數為212,358,717千元，截至95年2月4日921重建會結束，執行數205,285,213千元，執行率96.67%，未執行數7,072,948千元。