政府為安置組合屋內未曾受政府補貼安置，且災後無自有住宅之弱勢戶房屋租金，辦理受災戶慰助金、租金之核發，依據工程會民國88年9月29日（88）工程秘字第8815068號函，研擬「921地震安置受災戶租金發放作業要點」（草案），租金補助之發放對象包含自有房屋經評定為全倒或半倒者，未接受臨時屋、國宅或軍營安置者，發給房屋所有權人戶內實際居住人口租金補助每人每月新臺幣（以下同）3,000元，發放期限為1年。行政院於88年9月30日核定，並由內政部於88年9月30日台（88）內社字第8882307號函頒「921地震安置受災戶租金發放作業要點」，作為各鄉鎮市公所審核發給之依據，凡屬921地震影響之受災戶均適用，提供租金補助首次發放共316,096人次，計112億8,158萬6千元。原來申請房屋租金補助者建議政府繼續補助，依此，內政部於90年7月10日台（90）內社字第9022015號函核定公布「921震災原申領租金受災戶再發放租金一年作業要點」，第二期發放戶數6,307戶，支用經費計6億2,543萬元，及針對未有租屋事實或未訂定租約者予以改善居住生活補助費用，共5,479戶，計3億2,783萬元。另對921地震原申請第1年租金，卻無法出具租賃契約者，每戶核發6萬元的補助費，以改善其居住生活，共核發4,196戶，核發補助款2億6,156萬元。